MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidaminococcus intestini RyC-MR95 chromosome

Total Repeats: 41588

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016077	TTC	2	6	192	197	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352683412
2	NC_016077	A	6	6	253	258	100 %	0 %	0 %	0 %	352683412
3	NC_016077	AGA	2	6	291	296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352683412
4	NC_016077	GCT	2	6	300	305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352683412
5	NC_016077	AATG	2	8	315	322	50 %	25 %	25 %	0 %	352683412
6	NC_016077	ATAA	2	8	343	350	75 %	25 %	0 %	0 %	352683412
7	NC_016077	AGA	2	6	441	446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352683412
8	NC_016077	GCA	2	6	472	477	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352683412
9	NC_016077	CAAAG	2	10	480	489	60 %	0 %	20 %	20 %	352683412
10	NC_016077	TTC	2	6	528	533	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352683412
11	NC_016077	CAA	2	6	702	707	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	352683412
12	NC_016077	TCCA	2	8	781	788	25 %	25 %	0 %	50 %	352683412
13	NC_016077	AATA	2	8	814	821	75 %	25 %	0 %	0 %	352683412
14	NC_016077	A	6	6	867	872	100 %	0 %	0 %	0 %	352683412
15	NC_016077	GAA	2	6	886	891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352683412
16	NC_016077	TTC	2	6	892	897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352683412
17	NC_016077	ATC	2	6	934	939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352683412
18	NC_016077	GCC	2	6	1029	1034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	352683412
19	NC_016077	GAA	2	6	1062	1067	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352683412
20	NC_016077	CCA	2	6	1133	1138	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	352683412
21	NC_016077	GAA	2	6	1210	1215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352683412
22	NC_016077	CAG	2	6	1285	1290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352683412
23	NC_016077	ACA	2	6	1307	1312	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	352683412
24	NC_016077	GTAT	2	8	1376	1383	25 %	50 %	25 %	0 %	352683412
25	NC_016077	GGC	2	6	1435	1440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	352683412
26	NC_016077	CA	3	6	1447	1452	50 %	0 %	0 %	50 %	352683412
27	NC_016077	CTT	2	6	1646	1651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352683413
28	NC_016077	CAA	2	6	1686	1691	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	352683413
29	NC_016077	CTA	3	9	1769	1777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352683413
30	NC_016077	A	6	6	1880	1885	100 %	0 %	0 %	0 %	352683414
31	NC_016077	T	6	6	1914	1919	0 %	100 %	0 %	0 %	352683414
32	NC_016077	TTG	2	6	1959	1964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	352683414
33	NC_016077	AAG	2	6	2100	2105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352683414
34	NC_016077	CTG	2	6	2228	2233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352683414
35	NC_016077	TGA	2	6	2272	2277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352683414
36	NC_016077	A	6	6	2312	2317	100 %	0 %	0 %	0 %	352683414
37	NC_016077	GCA	2	6	2320	2325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352683414
38	NC_016077	GAC	2	6	2390	2395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352683414
39	NC_016077	CAT	2	6	2479	2484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352683414
40	NC_016077	ATT	2	6	2562	2567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352683414
41	NC_016077	TCC	2	6	2578	2583	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	352683414
42	NC_016077	TCGG	2	8	2596	2603	0 %	25 %	50 %	25 %	352683414
43	NC_016077	ACA	2	6	2667	2672	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	352683414
44	NC_016077	CAGC	2	8	2718	2725	25 %	0 %	25 %	50 %	352683414
45	NC_016077	GAA	2	6	2771	2776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352683414
46	NC_016077	TCC	2	6	2864	2869	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	352683414
47	NC_016077	ATG	2	6	2885	2890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352683414
48	NC_016077	TGA	2	6	2896	2901	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352683414
49	NC_016077	TCCT	2	8	2902	2909	0 %	50 %	0 %	50 %	352683414
50	NC_016077	AGC	2	6	2947	2952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352683414
51	NC_016077	CAT	2	6	2977	2982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352683415
52	NC_016077	TAT	2	6	3082	3087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	352683415
53	NC_016077	GCG	2	6	3088	3093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	352683415
54	NC_016077	TTTCG	2	10	3101	3110	0 %	60 %	20 %	20 %	352683415
55	NC_016077	ATG	2	6	3119	3124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352683415
56	NC_016077	GAT	2	6	3316	3321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352683415
57	NC_016077	GCG	2	6	3351	3356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	352683415
58	NC_016077	GCA	2	6	3432	3437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352683415
59	NC_016077	CT	3	6	3514	3519	0 %	50 %	0 %	50 %	352683415
60	NC_016077	GAA	2	6	3562	3567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352683415
61	NC_016077	CTATC	2	10	3628	3637	20 %	40 %	0 %	40 %	352683415
62	NC_016077	TCC	2	6	3666	3671	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	352683415
63	NC_016077	CTTTCT	2	12	3679	3690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352683415
64	NC_016077	GGCA	2	8	3695	3702	25 %	0 %	50 %	25 %	352683415
65	NC_016077	AAG	2	6	3710	3715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352683415
66	NC_016077	GAT	2	6	3778	3783	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352683415
67	NC_016077	AGG	2	6	3797	3802	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	352683415
68	NC_016077	CAG	2	6	3835	3840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352683415
69	NC_016077	TATCC	2	10	3904	3913	20 %	40 %	0 %	40 %	352683415
70	NC_016077	CTT	2	6	3916	3921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352683415
71	NC_016077	GTG	2	6	4034	4039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	352683415
72	NC_016077	GTTC	2	8	4057	4064	0 %	50 %	25 %	25 %	352683415
73	NC_016077	GGA	2	6	4074	4079	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	352683415
74	NC_016077	ATTG	2	8	4097	4104	25 %	50 %	25 %	0 %	352683415
75	NC_016077	GGC	2	6	4195	4200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	352683416
76	NC_016077	GCT	2	6	4300	4305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352683416
77	NC_016077	TGC	2	6	4306	4311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352683416
78	NC_016077	A	6	6	4333	4338	100 %	0 %	0 %	0 %	352683416
79	NC_016077	GAA	2	6	4391	4396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352683416
80	NC_016077	CGCGG	2	10	4444	4453	0 %	0 %	60 %	40 %	352683416
81	NC_016077	CTG	2	6	4462	4467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352683416
82	NC_016077	A	8	8	4558	4565	100 %	0 %	0 %	0 %	352683416
83	NC_016077	CAT	2	6	4765	4770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352683416
84	NC_016077	AAAG	2	8	4775	4782	75 %	0 %	25 %	0 %	352683416
85	NC_016077	AAC	2	6	4815	4820	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	352683416
86	NC_016077	A	6	6	4829	4834	100 %	0 %	0 %	0 %	352683416
87	NC_016077	ATC	2	6	4842	4847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352683417
88	NC_016077	CAA	2	6	4865	4870	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	352683417
89	NC_016077	CCG	2	6	4947	4952	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	352683417
90	NC_016077	ATC	2	6	4980	4985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352683417
91	NC_016077	AGA	2	6	5079	5084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352683418
92	NC_016077	GCAGA	2	10	5113	5122	40 %	0 %	40 %	20 %	352683418
93	NC_016077	CAT	2	6	5200	5205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352683418
94	NC_016077	TTG	2	6	5270	5275	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	352683418
95	NC_016077	GTT	2	6	5365	5370	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	352683418
96	NC_016077	CGG	2	6	5424	5429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	352683418
97	NC_016077	A	6	6	5491	5496	100 %	0 %	0 %	0 %	352683418
98	NC_016077	TGA	2	6	5607	5612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352683418
99	NC_016077	GAT	2	6	5710	5715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352683418
100	NC_016077	AT	3	6	5772	5777	50 %	50 %	0 %	0 %	352683418
101	NC_016077	CAA	2	6	5778	5783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	352683418
102	NC_016077	AAT	2	6	5902	5907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	352683418
103	NC_016077	AGA	2	6	5916	5921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352683418
104	NC_016077	TGA	2	6	6027	6032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352683418
105	NC_016077	GAA	2	6	6195	6200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352683418
106	NC_016077	TC	3	6	6219	6224	0 %	50 %	0 %	50 %	352683418
107	NC_016077	GC	3	6	6278	6283	0 %	0 %	50 %	50 %	352683418
108	NC_016077	GAA	2	6	6337	6342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352683418
109	NC_016077	TCG	2	6	6356	6361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352683418
110	NC_016077	GGC	2	6	6376	6381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	352683418
111	NC_016077	AAC	2	6	6478	6483	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	352683418
112	NC_016077	ATC	3	9	6565	6573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352683418
113	NC_016077	GCT	2	6	6612	6617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352683418
114	NC_016077	TTC	2	6	6625	6630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352683418
115	NC_016077	GCC	2	6	6681	6686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	352683418
116	NC_016077	GGA	2	6	6882	6887	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	352683418
117	NC_016077	CGC	2	6	6943	6948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	352683418
118	NC_016077	AGG	2	6	6996	7001	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	352683418
119	NC_016077	GCT	3	9	7013	7021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352683419
120	NC_016077	TTG	2	6	7072	7077	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	352683419
121	NC_016077	CTT	2	6	7107	7112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	352683419
122	NC_016077	GCT	2	6	7113	7118	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352683419
123	NC_016077	GA	3	6	7121	7126	50 %	0 %	50 %	0 %	352683419
124	NC_016077	GGGCT	2	10	7171	7180	0 %	20 %	60 %	20 %	352683419
125	NC_016077	GGGACA	2	12	7201	7212	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	352683419
126	NC_016077	A	6	6	7234	7239	100 %	0 %	0 %	0 %	352683419
127	NC_016077	GCT	2	6	7334	7339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352683419
128	NC_016077	GCG	2	6	7345	7350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	352683419
129	NC_016077	G	7	7	7354	7360	0 %	0 %	100 %	0 %	352683419
130	NC_016077	CGT	2	6	7427	7432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352683419
131	NC_016077	TGA	2	6	7439	7444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352683419
132	NC_016077	T	7	7	7459	7465	0 %	100 %	0 %	0 %	352683419
133	NC_016077	TGC	2	6	7522	7527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352683419
134	NC_016077	CAA	2	6	7619	7624	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	352683419
135	NC_016077	TGGC	2	8	7627	7634	0 %	25 %	50 %	25 %	352683419
136	NC_016077	GGC	3	9	7781	7789	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	352683420
137	NC_016077	CAA	2	6	7852	7857	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	352683420
138	NC_016077	CAC	2	6	7891	7896	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	352683420
139	NC_016077	TGC	2	6	7929	7934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352683420
140	NC_016077	TGC	2	6	8023	8028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352683420
141	NC_016077	AAG	2	6	8060	8065	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352683420
142	NC_016077	ATG	2	6	8151	8156	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	352683420
143	NC_016077	T	6	6	8159	8164	0 %	100 %	0 %	0 %	352683420
144	NC_016077	CAG	2	6	8226	8231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352683420
145	NC_016077	TCC	2	6	8424	8429	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	352683420
146	NC_016077	GC	3	6	8673	8678	0 %	0 %	50 %	50 %	352683421
147	NC_016077	CGG	2	6	8716	8721	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	352683421
148	NC_016077	ATGA	2	8	8734	8741	50 %	25 %	25 %	0 %	352683421
149	NC_016077	CAA	2	6	8757	8762	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	352683421
150	NC_016077	ATC	2	6	8810	8815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352683421
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153	NC_016077	GCT	2	6	8932	8937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	352683421
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156	NC_016077	ATC	2	6	9176	9181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352683421
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159	NC_016077	CAT	2	6	9507	9512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352683421
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219	NC_016077	TTTC	2	8	12521	12528	0 %	75 %	0 %	25 %	352683423
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225	NC_016077	T	6	6	13247	13252	0 %	100 %	0 %	0 %	352683424
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234	NC_016077	ATA	2	6	13574	13579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	352683424
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242	NC_016077	A	7	7	14205	14211	100 %	0 %	0 %	0 %	352683426
243	NC_016077	CAG	2	6	14220	14225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352683426
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246	NC_016077	GCA	2	6	14326	14331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	352683426
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248	NC_016077	GCTG	2	8	14344	14351	0 %	25 %	50 %	25 %	352683426
249	NC_016077	CAT	2	6	14372	14377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	352683426
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253	NC_016077	T	6	6	14715	14720	0 %	100 %	0 %	0 %	352683427
254	NC_016077	T	6	6	14758	14763	0 %	100 %	0 %	0 %	352683427
255	NC_016077	GAAT	2	8	14765	14772	50 %	25 %	25 %	0 %	352683427
256	NC_016077	AGA	2	6	14985	14990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352683427
257	NC_016077	A	7	7	15180	15186	100 %	0 %	0 %	0 %	352683428
258	NC_016077	AGA	2	6	15191	15196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	352683428
259	NC_016077	AT	3	6	15203	15208	50 %	50 %	0 %	0 %	352683428
260	NC_016077	A	7	7	15230	15236	100 %	0 %	0 %	0 %	352683428
261	NC_016077	A	7	7	15238	15244	100 %	0 %	0 %	0 %	352683428
262	NC_016077	TATC	2	8	15277	15284	25 %	50 %	0 %	25 %	352683428
263	NC_016077	A	6	6	15356	15361	100 %	0 %	0 %	0 %	352683428
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